部门，一是综合研发部，主要就是负责一些没有相应研究部门的项目，比如通讯机的研究改进就是由这个综合研发部负责，若是发现研发项目的具体分类，则会交由专业部门去研究。
第二个是灵能武器研发部，这很明显了，就是专门研究武器的，第三个是灵能机械研发部，这个部门研究的就是灵能机车、农业机械、包括灵核制造机和各种机床设备的改进，暂时热气球飞艇的改进和研究也归咎于这个部门，毕竟凌宇的反重力符文还没有搞出来，所以没有成立专门对飞艇进行研究部门。
研究所最重要职能就是进行各种研究和试制，以前的时候凌宇每次想要试制一个东西，都需要各处调遣工匠，现在不用了，研究所配备了足够的灵师和工匠，虽然不是科学院人数最多的机构，但是也暂时够用了，实在不够，再从一些相关的厂里调遣人手便是。
同时，凌宇取消了灵能工坊，将灵能工坊的灵师都派驻每个厂的研发部去，根据灵师们的比较擅长的领域去分配，当然研究所也是有着不少的灵师，主要也是辅助研究所的各种研究。
现在科学院的架构也清晰了许多，分为灵能科技研究所和工坊，工坊则下设3个厂，专门生产各种东西，军营则没有变动，不过军营本来就不属于科学院管辖，只是凌宇平日里都是在科学院工作，所以将军营设在科学院基地中，当然也是为了更好的保护科学院。
还有就是守护科学院的高级灵师，除了年行遇，周正雄又派来一位女性八级后期灵师俞梦竹，与年行遇一同守护科学院最重要的部分，也就是科学院的档案馆，里面存放了大量开设科学院以来凌宇以及科学院所有研究人员的各种研究资料，若是失窃或者发生什么事故，那损失将会很大。
至于周少斌，他没有什么具体职位，硬要说他明面上的职位嘛，就是科学院副院长了，主要职责就是配合凌宇管理科学院，凌宇不在的时候则由他顶上。
说起周少斌，不得不说这段时间他成长了不少，虽然周少斌有着各种缺点，但是做事情上还是靠谱的，改组科学院这段时间，他帮助凌宇处理了许多事情，当然也得到了不少的锻炼。
忙活了这大半个月，凌宇还是相当有成就感的，因为改组后的科学院和工坊职能清晰，互不干扰又可以相互协作，这让凌宇对于各种事情处理起来也轻松了许多。
就比如说研究所吧，凌宇提出的新想法，就会交给研究去研究和制造，以前的时候，凌宇都是拿出已经制作好的设计图让工坊试制，但是这
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