此时的神农被功德包裹，沐森取出崆峒印，轻声呵道：“人皇，立。”崆峒印发出一声龙吟，一道粗壮的人皇龙气骤然飞出，直接没入了神农氏体内，神农氏顿时气势暴涨。
不消多时，功德金光消失，神农氏也如同伏羲一般，修为提升至准圣巅峰，证得人皇道果，从此万灾不磨，量劫不灭，神农氏向孔宣拜了拜，以了孔宣与他之间的师徒情分，毕竟如今他已是人皇，不能再以孔宣弟子相称了，毕竟要顾及其他人的身份。
人皇交接完毕，众圣便陆续离去，只有元始天尊留下，叮嘱了广成子几句，随后也离开了，伏羲和神农氏见众圣离去，人皇交接也已完成，神农氏上前对轩辕笑道：“皇弟，人族便交给你了，吾与皇兄在火云洞等你。”说罢，也不待轩辕答话，便与伏羲、人族四祖等驾云朝人族圣地飞去。
轩辕一听神农氏所说，也不顾伏羲神农氏二人早已飞远，当即跪倒在地大声道：“轩辕定当不负二位共主所托，当竭尽全力守护人族。”众人族也皆是拜倒在地，恭送二位人皇与人祖，直到众人消失于天际，众人族才起身，
自此，人族进入了人皇轩辕的时代。
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九黎部落，蚩尤在得知轩辕氏承继人族共主之位后，便认为时间已然成熟，如今轩辕氏刚刚承袭人族共主之位，地位不稳，正是起兵的好时机，而且下手的对象正是轩辕氏出生的有熊部落。
而此时的有熊部落，轩辕虽于很久之前便开始命人整兵备戈，操练兵马，可自轩辕随神农氏去了陈都之后，有熊部落便开始有所懈怠，如今又怎会是巫族带领的九黎之众的对手，几番大战下来，便被杀的丢盔弃甲，大败而归。
一时间，蚩尤与九黎部落声势大振，而轩辕却是威望大减，原本在神农氏传位与轩辕之时，众人对轩辕的接位还是报以怀疑的态度，虽然轩辕氏素有贤名，但毕竟对人族并无什么贡献，不向伏羲和神农氏，在未成为人族共主前，一个教会了人族渔牧，一个教会了人族种植五谷。
如今九黎攻来，轩辕大败，更是让众人开始怀疑轩辕是否有能力引导人族，有熊联盟之中也是开始出现裂痕，
如此，轩辕顿时陷入了内忧外患之境，人族之中有些部落已是不再听从轩辕的号令，令轩辕尴尬不已。
最主要的是，之前观看过人皇证道的那些族长，他们部落可都是人族中较强的部落，若是有他们相助，轩辕氏也能轻松些
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